生物信息学

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服务介绍

ChIP-seq测序技术服务      

       染色质免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipition, ChIP)是研究体内蛋白质与DNA相互作用的经典实验方法,与第二代测序技术相结合,ChIP Sequencing(ChIP-seq)可以在全基因组范围内对蛋白的结合位点进行高效而准确的筛选与鉴定,广泛应用于组蛋白修饰,特定转录因子的基因调控作用研究等相关领域,为差异化表观遗传变异的原理揭示提供了重要的解决思路。

       正茂拥有熟练的ChIP-seq测序技术和一流的ChIP-seq测序平台,我们的ChIP-seq测序服务具有以下优点:1.高灵敏度:数字化的测序数据提供精确识别的低丰度的ChIP序列及数量信息;2.可靠性高:比ChIP-Chip具有更低的背景,无交叉杂交非特异性;3.性价比高:基于抗体富集目标区域,有效降低测序数据量;4.检测范围广:可在全基因组范围内鉴定转录因子/组蛋白的结合位点;5.更低的样本起始量:仅需10ng(单次)以上免疫沉淀后的DNA。

服务内容

1.ChIP-DNA测序

2. 标准信息分析:

    1). 去接头污染,去低质量reads和产量情况统计;

    2). ChIP测序序列与参考基因组序列的比对;

    3). ChIP测序唯一reads在全基因组的分布;

    4). 统计ChIP测序数据富集区域(Peak)的信息;

    5). Peak相关基因筛选与GO功能聚类分析、Pathway分析;

    6). 多个样品间的定量差异分析;

    7). UCSC genome browser使用说明。

3. 个性化分析。

服务说明

      1. 样品类型:ChIP-ed DNA样品;

      2. 样品需求量:≥10ng(单次),请尽可能提供两次以上的用量,以确保实验质量及重复性;若单次ChIP后DNA量不够,建议将2~3次ChIP的DNA合并在一起;

      3. 样品浓度:≥1ng/ul;

      4. 样品纯度:OD260/OD280=1.8-2.0;

      5. DNA片段大小:分布在100-500 bp,主峰分布在200-300bp。请提供DNA打断后的检测胶图以确定DNA片段大小是否符合要求,并提供ChIP后的q-PCR验证结果;

      6. 数据量:20M clean reads /样本;

      7. 项目运转周期:标准流程的运转周期为约30个工作日;

      8. 若另有疑问欢迎向本公司咨询,我们将竭诚为您服务。

质量承诺

      1.准确可靠的ChIP-seq测序结果;

      2.专业权威的ChIP-seq测序分析报告;

      3.真实的原始实验数据;

      4.详细的实验步骤。